8,6
8,5
8,4
Freebe pour le suivi ultra-fin des seuils micro, Tiime pour la facturation gratuite parfaitement adaptée à la micro, et Abby comme alternative française solide.
- Top 3 pour micro-entreprise, Freebe (8,6), Tiime (8,5), Abby (8,4).
- Un logiciel spécialiste micro (Freebe, Abby, Bizyness) suffit tant que tu es en micro pur.
- Prix, de 0 €/mois (Tiime facturation) à 23 € (Indy Pro). Aucun besoin de logiciel « société » à 30-100 €/mois.
- Vérifier le suivi des seuils CA (77 700 / 188 700 €) et de la franchise TVA (91 900 / 36 800 €, seuils 2026 à vérifier).
- Facturation électronique 2026 concerne aussi les micro B2B (PDP agréée obligatoire).
En micro-entreprise, la compta est ultra-simplifiée sur le papier : livre des recettes, registre des achats en BIC, télédéclaration URSSAF, un formulaire 2042-C-PRO en fin d’année. Mais il y a trois pièges qui font tomber ceux qui pilotent au doigt mouillé : les seuils de CA (77 700 € services BIC ou BNC, 188 700 € vente), la franchise TVA (91 900 € vente, 36 800 € services en 2026, seuils à revérifier sur impots.gouv.fr), et la facturation électronique obligatoire pour toutes les factures B2B. Bien choisi, ton logiciel te warn en amont sur les trois. Mal choisi, tu te réveilles avec un rattrapage TVA rétroactif. J’ai décortiqué les dix outils qui reviennent le plus souvent chez les micro-entrepreneurs, freelances et professions libérales : documentation, démos, avis Trustpilot, forums micro-entrepreneurs. Voilà ce qui tient la route en 2026.
Logiciel comptable micro-entreprise : le comparatif 2026
| # | Solution | Type | Prix HT/mois | Bilan certifié | Idéal pour | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 01 | Freebe | Logiciel | 12,50 € | ✗ | Freelance et prestation micro | 8,6 |
| 02 | Tiime | Logiciel | 0 € | ✗ | Facturation micro gratuite | 8,5 |
| 03 | Abby | Logiciel | 0-26,40 € | ✗ | Micro qui démarre gratuit | 8,4 |
| 04 | Indy | Logiciel | dès 23 € | ✗ | Micro-BNC libéral (kiné, coach) | 8,0 |
| 05 | Bizyness | Logiciel | 9-19 € | ✗ | Spécialiste auto-entrepreneur | 7,8 |
| 06 | Henrri | Logiciel | 0 € | ✗ | Facturation gratuite historique | 7,7 |
| 07 | Solo by Shine | Logiciel + compte pro | dès 8 € | ✗ | Micro tout-en-un banque | 7,6 |
| 08 | Sinao | Logiciel | 6,90-19 € | ✗ | Compta pragmatique freelance | 7,5 |
| 09 | Macompta.fr | Logiciel | dès 12 € | ✗ | Micro qui bascule vers EI réel | 7,5 |
| 10 | QuickBooks Auto-Entrepreneur | Logiciel | dès 5 € | ✗ | Micro qui veut du prix bas | 7,4 |
Trois entrées en tête, trois usages proches. Freebe, c’est le spécialiste pur du micro-entrepreneur qui suit tes seuils au jour près. Abby, c’est l’alternative freemium française avec une UI plus moderne. Tiime, c’est la facturation gratuite conforme facturation électronique 2026, parfaite pour rester ultra-léger. Trois angles différents pour le même sujet : bien tenir sa micro sans se faire piéger par les seuils.
Prix constatés en 2026 sur les sites officiels. À revérifier avant de signer, les grilles bougent souvent en cours d’année.
Comment j’ai analysé ces 10 logiciels comptables pour micro-entreprise
J’aime bien savoir, avant de lire un comparatif, comment le mec qui l’a écrit s’y est pris. Donc je te le dis.
- Sources consultées : documentation officielle de chaque éditeur, pages tarifs à jour, démos produit en vidéo, avis clients agrégés Trustpilot / Google / G2, discussions Reddit (r/freelance_fr, r/AutoEntrepreneur, r/entrepreneur), articles comparatifs indépendants, forums micro-entrepreneurs.
- Angles d’analyse : couverture des obligations en micro-entreprise (livre des recettes, registre des achats BIC, télédéclaration URSSAF, facturation électronique 2026, suivi des seuils CA et franchise TVA), rapport qualité-prix affiché, transparence tarifaire, pertinence pour un micro pur (pas pour une société), spécificités techniques (API, UX mobile, sync bancaire).
- Ce que je n’ai PAS fait, en toute honnêteté : je n’ai pas ouvert un compte payant sur chaque outil ni fait tourner un exercice comptable complet sur douze mois. Ce classement est une synthèse documentaire ; à confronter à ton propre essai gratuit avant de t’engager.
- Mise à jour au fil des changements de grilles tarifaires, plusieurs fois par an, sans calendrier fixe.
Sur ce marché, le prix affiché est rarement le prix final : un logiciel gratuit peut coûter cher en heures perdues, un abonnement premium peut être rentabilisé en une seule question fiscale bien répondue. J’ai donc pondéré au-delà du seul tarif.
Le classement des 10 logiciels comptables micro-entreprise, un par un
LE logiciel préféré des micro-entrepreneurs sur les forums freelance. Simplicité extrême, focus 100 % micro. Livre des recettes conforme, alerte quand tu approches du seuil TVA franchise, calcul URSSAF selon activité BIC ou BNC, gestion du versement libératoire IR si tu y es éligible.
- ✓Suivi seuils URSSAF et TVA parfait, alerte en amont
- ✓Interface hyper focalisée, pas de features inutiles
- ✓Facturation Stripe et GoCardless bien pensée
- ✗100 % micro, si tu bascules au réel il faut changer d’outil
- ✗Engagement annuel obligatoire
Le logiciel de facturation et notes de frais qui alimente en réalité la plupart des solutions comptables du marché. Pour une micro, c’est le plan gratuit imbattable pour émettre des factures conformes facturation électronique 2026. Tu peux le prendre seul, gratuitement, mais tu restes responsable du suivi de tes seuils CA et de ta télédéclaration URSSAF.
- ✓Gratuit sur la brique facturation, imbattable
- ✓Meilleure app mobile compta du panel
- ✓Conforme facturation électronique 2026 (PDP agréée)
- ✗Pas de suivi automatique des seuils CA micro ni du seuil TVA franchise
- ✗Tu restes juridiquement responsable de ta déclaration URSSAF et de ton 2042-C-PRO
Jeune acteur français qui pousse un plan gratuit vraiment fonctionnel pour la micro-entreprise. Facturation, livre des recettes, suivi CA en temps réel, alerte seuils. UI mobile agréable. Positionnement freemium clair pour un micro qui démarre et veut zéro engagement.
- ✓Plan gratuit le plus complet du marché à date
- ✓UI mobile agréable, très moderne
- ✓Suivi CA temps réel, alertes seuils
- ✗Fonctionnalités plus légères que Freebe sur les cas avancés (versement libératoire, ACRE)
- ✗Pas d’API publique à date
Le champion des professions libérales (kiné, coach, consultant, thérapeute). Pensé au départ pour la déclaration 2035 en BNC déclaratif contrôlé, mais son plan Pro à 23 €/mois convient très bien à un micro-BNC qui veut suivre son activité, ses seuils et sa TVA sans se prendre la tête.
- ✓Spécialiste BNC, connaît les codes libéral
- ✓Sync bancaire propre, catégorisation auto
- ✓Interface hyper claire, très ergonomique
- ✗Moins pertinent pour un micro-BIC vente
- ✗Prix plan Pro un cran au-dessus de Freebe pour un micro pur
Éditeur français 100 % focalisé auto-entrepreneur / micro. Suivi automatique des seuils CA (77 700 / 188 700 €) et surtout du seuil TVA franchise, avec alerte quand tu approches. Idéal pour un micro qui pilote sérieusement sans tomber dans un rattrapage TVA rétroactif.
- ✓Suivi seuils CA et franchise TVA vraiment automatique
- ✓Livre des recettes et registre des achats conformes BOFiP
- ✓Télédéclaration URSSAF facilitée depuis l’outil
- ✗Pas de conseiller humain, tu pilotes seul
- ✗Notoriété moindre que Freebe ou Abby
Édité par Rivalis, Henrri est un logiciel de facturation 100 % gratuit orienté micro et TPE. Interface un peu vieillissante mais fait le job pour émettre des factures et suivre le CA.
✗ UI datée, mobile perfectible, pas d’alerte seuils avancée
Prix : 0 €/mois
Voir le site officiel →
L’offre de Shine dédiée aux micro-entrepreneurs. Compte pro plus outil de facturation plus suivi URSSAF dans une seule app mobile. Pratique si tu veux tout centraliser au même endroit sans jongler entre banque et logiciel.
✗ Moins pointu que Freebe sur les cas fiscaux avancés
Prix : dès 8 €/mois HT
Voir le site officiel →
Logiciel français orienté freelance et TPE, moins connu que les leaders mais souvent recommandé sur les forums freelance. Fonctionnalités correctes en micro-BNC, prix contenu. Bien si tu es en profession libérale non réglementée.
✗ Écosystème plus discret que les leaders
Prix : 6,90-19 €/mois HT
Voir le site officiel →
Logiciel comptable en ligne français, historiquement plus orienté TPE-PME. Intéressant pour un micro qui prépare la bascule EI au réel car il gère la compta d’engagement complète (bilan, TVA, immobilisations) que la micro n’exige pas mais qui deviendra obligatoire au réel.
✗ Interface plus classique, orientée pratique comptable
Prix : dès 12 €/mois HT
Voir le site officiel →
La déclinaison française d’Intuit QuickBooks, adaptée au régime auto-entrepreneur. Facturation, suivi CA, connexion bancaire, calcul URSSAF. Argument principal : prix agressif à l’entrée, mais moins pointu que les spécialistes français sur les subtilités locales.
✗ Moins fin que Freebe ou Bizyness sur les seuils et le versement libératoire
Prix : dès 5 €/mois HT
Voir le site officiel →
Le vrai point de bascule d’une micro : rester en micro ou passer à l’EI au réel ?
La vraie question en micro, ce n’est pas « logiciel seul vs logiciel avec conseiller ». C’est « à partir de quel CA je dois passer au réel ou basculer en SASU ». Un logiciel micro te warn en amont ou pas. Un mauvais te laisse découvrir le problème au moment du bilan.
Trois déclencheurs à surveiller : tu approches 77 700 € (services BIC ou BNC) ou 188 700 € (vente), tu approches ou tu dépasses le seuil de franchise TVA (91 900 € vente, 36 800 € services), ou tu as beaucoup de frais professionnels (matériel, sous-traitance, déplacements) qui ne sont pas déductibles en micro puisque l’abattement est forfaitaire (34 % BNC, 50 % services BIC, 71 % vente).
Un logiciel micro (Freebe, Abby, Bizyness) suffit tant que tu es clairement en micro. Dès que tu approches les seuils ou que tes frais dépassent l’abattement forfaitaire, tu dois consulter un expert-comptable indépendant qui te dira si l’EI au réel te fait gagner de l’argent. Ce n’est pas un abonnement mensuel, c’est un rendez-vous ponctuel de bascule.
- Freebe seul : 150 €/an
- Abby seul : 108 €/an (Pro), 0 € sur le plan gratuit
- Tiime facturation gratuit + expert-comptable ponctuel (bilan de bascule) : 500 à 1 200 € one-shot
- Indy Pro : 276 €/an
Un logiciel micro reste largement rentable tant que ta compta n’a pas de subtilité. Le coût du passage au réel se joue en accompagnement ponctuel, pas en abonnement mensuel supplémentaire.
- Livre chronologique des recettes obligatoire
- Registre des achats obligatoire pour activités BIC de vente
- Télédéclaration URSSAF mensuelle ou trimestrielle (12,3 % vente, 21,2 % services BIC, 23,1 % BNC non-CIPAV, 23,2 % BNC CIPAV en 2026)
- Déclaration annuelle sur 2042-C-PRO, versement libératoire IR possible sur option
- Compte bancaire dédié obligatoire dès 10 000 € de CA sur 2 ans consécutifs
- Facturation électronique 2026 via PDP agréée pour toute facture B2B
Seuils CA et franchise TVA : les deux pièges qui font tomber les micro-entrepreneurs
Les seuils de CA d’abord. En micro, tu es plafonné à 77 700 € HT en services (BIC prestation ou BNC) et 188 700 € HT en vente de marchandises et hébergement. Dès que tu approches, tu dois anticiper la bascule vers l’EI au réel ou la création d’une SASU (ou EURL). Le régime micro reste possible tant que tu ne dépasses pas deux années consécutives, mais autant se préparer. Un logiciel qui te warn en amont vaut de l’or. Freebe, Abby et Bizyness le font. Tiime facturation aussi, plus discrètement.
La franchise TVA, le sujet le plus glissant. Les seuils 2026, tels que confirmés à date après la suspension de la réforme à 25 000 € début 2026, restent à 91 900 € HT en vente et 36 800 € en services (seuils majorés 101 000 / 39 100 €). À revérifier sur impots.gouv.fr avant chaque prise de décision, le dossier bouge. Le jour où tu franchis le seuil majoré, tu factures la TVA rétroactivement au premier jour du mois de dépassement. Concrètement, si tu passes de 36 000 à 40 000 € de CA services en une facture de fin de mois, tu dois refacturer la TVA sur toutes les factures du mois. Beaucoup de logiciels grand public gèrent mal cette rétroactivité.
Facturation électronique 2026. Oui, ça concerne aussi les micro-entrepreneurs, pas juste les sociétés. Toute facture B2B doit passer par une Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP) agréée. Vérifie que ton logiciel s’appuie sur une PDP agréée par la DGFiP. Tiime, Freebe et Abby le sont notamment. En B2C tu peux continuer une facture papier ou PDF, mais mieux vaut standardiser.
- Cotisations URSSAF 2026 : 12,3 % vente, 21,2 % services BIC, 23,1 % BNC non-CIPAV, 23,2 % BNC CIPAV. À déclarer mensuellement ou trimestriellement.
- Versement libératoire IR (option) : 1 % vente, 1,7 % services BIC, 2,2 % BNC. Éligible si RFR N-2 sous plafond.
- Registre des achats obligatoire pour les activités BIC de vente, pas pour les services.
Questions fréquentes sur le logiciel comptable micro-entreprise
Mon verdict : le meilleur logiciel comptable micro-entreprise
Si tu démarres en micro et restes loin des seuils : Tiime facturation gratuit couvre la facturation électronique 2026, plus Freebe (12,50 €/mois) ou Abby (plan gratuit) pour le livre des recettes et le suivi des seuils. Simple, efficace, rentable.
Si tu es en BNC libéral (kiné, coach, consultant) : Indy est le plus visible et le plus adapté sur ces recherches, plan Pro à 23 €/mois. Il connaît les codes du libéral et catégorise proprement ta sync bancaire.
Si tu approches des seuils micro : reste sur ton logiciel micro et prends un rendez-vous ponctuel avec un expert-comptable indépendant pour arbitrer la bascule EI au réel ou SASU. Un bilan de bascule se paie 500 à 1 200 € one-shot, pas un abonnement mensuel supplémentaire.
Ce que je te déconseille : payer un logiciel « société » à 30-100 €/mois alors que tu es en micro (Sage 50, EBP, Pennylane sont hors cible), ou rester en micro sans suivi des seuils. Les deux erreurs coûtent cher, pour des raisons opposées.
Le vrai enjeu en micro, ce n’est pas de trouver le meilleur logiciel. C’est de savoir quand tu passes de la micro à autre chose. Un bon logiciel micro te warn en amont. Un mauvais te laisse découvrir le dépassement au moment du bilan.
Sources et Références
- Service-Public.fr, Fiche micro-entrepreneur · entreprendre.service-public.fr
- autoentrepreneur.urssaf.fr, Cotisations, déclarations et versement libératoire
- BOFiP-Impôts, Régime micro-BIC et micro-BNC
- impots.gouv.fr, Franchise en base de TVA (seuils 2026)
- DGFiP, Facturation électronique 2026 et liste des PDP agréées
Passionné d’investissement et d’entrepreneurs. Je gère ma trésorerie et mes activités comme un investisseur, pas comme un comptable. Ce classement sort de mes propres arbitrages, pas d’un communiqué de presse.
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