9,3
9,2
8,5
Le premium, le rapport qualité-prix, et l’outil gratuit qui tient.
- Top 3 pour secrétaire indépendante, L-Expert-Comptable.com (9,3), Swapn Compta (9,2), Tiime (8,5).
- Deux modèles, logiciel seul (Tiime, Indy, Pennylane) ou logiciel plus expert-comptable dédié.
- Prix, de 0 €/mois en freemium à 99 € HT/mois pour un cabinet en ligne complet.
- Vérifier le statut PDP DGFiP pour la conformité facture électronique 2026-2027.
- Spécificité, BIC prestation de services et facturation TPE en abonnement.
Secrétaire indépendante, tu vends du temps à des professions libérales (avocats, kinés) ou des TPE. Prestations administratives = BIC prestation de services (attention : c’est du BIC, pas du BNC). Souvent micro-entreprise, franchise TVA jusqu’à 39 100 €. Le logiciel doit être simple. J’ai analysé les dix références 2026.
Logiciel comptable secrétaire : le comparatif 2026
| # | Solution | Type | Prix HT/mois | Bilan certifié | Idéal pour | Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 01 | L-Expert-Comptable.com | Logiciel + conseiller | dès 69 € | ✓ | Le choix premium | 9,3 |
| 02 | Swapn Compta | Logiciel + conseiller | dès 29 € | ✓ | Meilleur rapport qualité-prix | 9,2 |
| 03 | Tiime | Logiciel | 0 € | ✗ | Facturation gratuite | 8,5 |
| 04 | Indy | Logiciel | 0-23 € | ✗ | Solopreneur libéral | 7,4 |
| 05 | Freebe | Logiciel | 12,50 € | ✗ | Micro-entrepreneur pur | 8,0 |
| 06 | Abby | Logiciel | 0-26,40 € | ✗ | Micro qui démarre | 7,8 |
| 07 | Sinao | Logiciel | 6,90-19 € | ✗ | Le logiciel comptable prag | 7,7 |
| 08 | Macompta.fr | Logiciel | dès 12 € | ✗ | Le logiciel pour TPE qui g | 7,6 |
| 09 | Henrri | Logiciel | 0 € | ✗ | L’alternative gratuite | 7,5 |
| 10 | Evoliz | Logiciel | dès 15 € | ✗ | Logiciel facturation TPE-P | 7,5 |
Trois entrées en tête, trois rôles. Tiime, c’est l’outil. Swapn et L-Expert-Comptable, ce sont les logiciels comptables avec conseiller qui l’intègrent. Tu prends Tiime pour facturer proprement. Tu prends Swapn ou L-Expert-Comptable pour qu’on tienne ta compta et qu’on signe ton bilan à ta place. Pas trois concurrents, trois rôles.
Prix constatés en 2026 sur les sites officiels. À revérifier avant de signer, les grilles bougent souvent en cours d’année.
Comment j’ai analysé ces 10 logiciels comptables secrétaire indépendante
J’aime bien savoir, avant de lire un comparatif, comment le mec qui l’a écrit s’y est pris. Donc je te le dis.
- Sources consultées : documentation officielle de chaque éditeur, pages tarifs à jour, démos produit en vidéo, avis clients agrégés Trustpilot / Google / G2, discussions Reddit (r/freelance_fr, r/entrepreneur), articles comparatifs indépendants, forums métier.
- Angles d’analyse : couverture des obligations pour une secrétaire indépendante (facturation électronique 2026, TVA selon régime, déclarations sociales et fiscales), rapport qualité-prix affiché, transparence tarifaire, notoriété et pérennité de l’éditeur, spécificités techniques (API, UX mobile, sync bancaire).
- Ce que je n’ai PAS fait, en toute honnêteté : je n’ai pas ouvert un compte payant sur chaque outil ni fait tourner un exercice comptable complet sur douze mois. Ce classement est une synthèse documentaire ; à confronter à ton propre essai gratuit avant de t’engager.
- Mise à jour au fil des changements de grilles tarifaires, plusieurs fois par an, sans calendrier fixe.
Sur ce marché, le prix affiché est rarement le prix final : un logiciel gratuit peut coûter cher en heures perdues, un abonnement premium peut être rentabilisé en une seule question fiscale bien répondue. J’ai donc pondéré au-delà du seul tarif.
Le classement des 10 logiciels comptables secrétaire indépendante, un par un
Le vétéran français du logiciel comptable accompagné d’un conseiller humain. Plus de 15 000 entrepreneurs, 15 ans d’existence, inscrits à l’Ordre des Experts-Comptables. Le bilan qu’ils te produisent tient devant un contrôle fiscal.
- ✓Comptable dédié qu’on connaît personnellement
- ✓Bilan et liasse certifiés, tu dors tranquille en contrôle
- ✓Vraie création d’entreprise incluse (juridique + INPI)
- ✗Prix supérieur à Swapn pour service équivalent
- ✗Interface un peu datée face aux fintechs pures
La solution qui m’a le plus impressionné sur ce panel. Logiciel comptable avec conseiller humain, dès 29 € HT/mois, sans engagement. Deux fois moins cher que L-Expert-Comptable, avec le même service sur la plupart des cas d’usage pour une secrétaire indépendante.
- ✓Meilleur rapport qualité-prix du marché
- ✓Sans engagement, résiliable au mois
- ✓Note Google 5/5 sur 640 avis, Trustpilot 4,9/5
- ✓App Tiime incluse, tu factures depuis ton téléphone
- ✗Marque plus jeune que L-Expert-Comptable
- ✗Équipe de comptables plutôt que nominatif unique
Le logiciel de facturation et notes de frais qui alimente en réalité Swapn et L-Expert-Comptable côté outil. En tête après eux parce que c’est l’outil qu’ils utilisent côté logiciel. Tu peux le prendre seul, gratuitement, mais tu restes responsable de ta compta et de ton bilan.
- ✓Gratuit sur la brique facturation, imbattable
- ✓Meilleure app mobile compta du panel
- ✓Conforme facturation électronique 2026 (PDP agréée)
- ✗Ne fait pas ton bilan, il faut un conseiller comptable en face
- ✗Tu restes juridiquement responsable en cas de contrôle
Indy (ex-Georges) est le logiciel comptable freelance le plus visible en SEO. Plan Free limité, plan Pro à 23 €. Interface soignée mais reste un logiciel, il ne signe pas ton bilan.
- ✓Interface lisible, simulateur IS et rémunération
- ✓Bon accompagnement doc pour les libéraux
- ✓Plan gratuit correct pour démarrer
- ✗Plan Free plafonne vite, coût réel Pro : 276 €/an
- ✗Ne remplace pas un conseiller inscrit à l’Ordre
LE logiciel préféré des micro-entrepreneurs sur les forums freelance. Simplicité extrême, focus 100 % micro. Le seul qui te met un warning explicite quand tu approches du seuil TVA franchise.
- ✓Suivi seuils URSSAF et TVA parfait
- ✓Interface hyper focalisée, pas de features inutiles
- ✓Facturation Stripe et GoCardless bien pensée
- ✗100 % micro, si tu passes en société il faut changer
- ✗Engagement annuel obligatoire
Jeune acteur français qui pousse un plan gratuit vraiment fonctionnel. UI mobile agréable, positionnement freemium clair. Cible micro qui débute.
- ✓Plan gratuit le plus complet du marché à date
- ✓UI mobile agréable
- ✗Fonctionnalités plus légères que les leaders, cible micro qui démarre
- ✗Pas d’API publique à date
Logiciel français orienté freelance et TPE, moins connu que les leaders mais souvent recommandé sur les forums métier. Fonctionnalités correctes, prix contenu.
✗ Écosystème plus discret que les leaders
Prix : 6,90-19 €/mois HT
Voir le site officiel →
Logiciel comptable en ligne français, plus orienté TPE-PME que freelance solo. Fonctions comptables complètes (bilan, TVA, immobilisations).
✗ Interface plus classique, orientée pratique comptable
Prix : dès 12 €/mois HT
Voir le site officiel →
Logiciel de facturation en ligne gratuit, alternative à Tiime pour la partie devis-factures. Version premium payante pour les fonctions avancées.
✗ Positionnement plus centré desktop que mobile-first
Prix : 0 €/mois HT
Voir le site officiel →
Logiciel français facturation et relances clients, bien positionné TPE-PME classique.
✗ Plus centré facturation que tenue comptable complète
Prix : dès 15 €/mois HT
Voir le site officiel →
Le point de bascule : logiciel seul, ou logiciel avec un conseiller ?
C’est LA question qui trie tout le comparatif. Résumé de ce que j’ai compris à force de croiser documentation et retours d’utilisateurs.
Un logiciel comptable t’outille : facturation, sync bancaire, saisie, TVA, exports FEC. Il t’aide à faire ta compta toi-même. Il ne signe rien à ta place. Il n’engage pas sa responsabilité en cas de contrôle.
Un logiciel comptable avec un conseiller (Swapn, L-Expert-Comptable) tient ta compta pour toi. Le conseiller humain, inscrit à l’Ordre, signe ton bilan et ta liasse fiscale. Il te conseille par téléphone, chat, email. Il engage sa RC pro.
- Régime BIC prestations de services (pas BNC)
- Déclaration 2031 (au réel) ou micro-BIC
- URSSAF Indépendants
- Franchise TVA à 39 100 € en 2026
- Facturation électronique 2026 obligatoire
Secrétaire indépendante : BIC prestations, pas BNC
Point souvent mal compris : la secrétaire indépendante est en BIC prestations de services commerciaux, pas en BNC. La distinction vient de la nature de l’activité : le secrétariat externalisé est considéré comme une prestation commerciale (comme un service de nettoyage), pas comme une profession libérale intellectuelle.
Conséquence pratique : micro-BIC avec abattement forfaitaire de 50 % (contre 34 % en micro-BNC). Tu déclares tes recettes, tu paies tes cotisations sur 50 % du CA. Plus favorable qu’un consultant en BNC pour un revenu équivalent.
Seuils micro-BIC prestations de services 2026 : 83 600 €. Au-delà, bascule au réel BIC (déclaration 2031). La franchise TVA reste à 39 100 € (seuil services).
Questions fréquentes sur le logiciel comptable secrétaire indépendante
Mon verdict : le meilleur logiciel comptable secrétaire
Si tu es secrétaire indépendante micro-BIC : Freebe, Abby ou Tiime gratuit. Suffit largement.
Si tu bascules au réel BIC (2031) : Swapn 29 € HT/mois avec conseiller inclus, ou L-Expert-Comptable dès 39 €.
À éviter : confondre BIC prestations (abattement 50 %) et BNC (abattement 34 %). Deuxième erreur : dépasser le seuil TVA franchise sans avoir prévu la bascule au réel.
Sources et Références
- URSSAF Indépendants, Micro-BIC prestations
- BOFiP-Impôts, Régime micro-BIC 2026
- Service-Public.fr, Secrétariat indépendant
- INPI, Guichet des formalités
- DGFiP, Facturation électronique 2026
Passionné d’investissement et d’entrepreneurs. Je gère ma trésorerie et mes activités comme un investisseur, pas comme un comptable. Ce classement sort de mes propres arbitrages, pas d’un communiqué de presse.
15 jours d’analyse benchmark
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